灵活就业人员按照60%和100%缴纳养老保险，退休后的养老金不完全是40%的差距，除了缴费标准以外，还有缴费年限，退休前上年度职工月平均工资等，不同的影响因素，对于养老金的影响不完全相同。

在同一个统筹区缴纳企业职工基本养老保险，灵活就业人员的缴费基数都是按照省级人社部门公布的缴费基数，和缴费基数的上限和下限来选择缴费档次，按照60%缴纳企业职工基本养老保险，就属于按照缴费下限来缴纳的养老保险，缴费基数是根据上年度城镇单位就业人员的月平均工资为依据的，由于每年城镇单位就业人员的月平均工资不一样，即使每年都按照60%的标准缴费，缴费的金额也是完全不一样的。

为了更好地回答这个问题，由于无法预测每一年的缴费基数是多少，我们只能按照平均缴费基数的方式来做一个模拟对比计算，看看按照60%和100%缴费，退休后养老金有多大的差别。

假如平均缴费基数为每月6000元，缴费年限20年，在同一个地方办理退休，退休时的养老金计发基数按照8000元，退休年龄为60岁，我们分别来对比一下按照60%缴费和100%缴费，养老金差距有多大。

按照100%缴费，平均每月的缴费基数为6000元，每月计入个人账户资金余额为480元，缴费20年个人账户累计为115200元；按照60%缴费，平均缴费基数为3600元，缴费20年的个人账户累计为69120元。为了保持计算的公平性，个人账户部分均不计算个人账户资金利息。

按照100%缴费20年：

基础养老金：养老金计发基数8000元加上计发基数乘以1除以2，二者的平均值为每月8000元，每缴费一年的基础养老金为80元，缴费20年，每月的基础养老金为1600元。

个人账户养老金：个人账户余额115200元（不含利息收入）除以139，每月个人账户养老金为828.78元。

合计每月养老金为2428.78元。

按照60%缴费20年：

基础养老金：养老金计发基数8000元加上计发基数乘以0.6除以2，二者的平均值为每月6400元，每缴费一年的基础养老金为64元，缴费20年，每月的基础养老金为1280元。

个人账户养老金：个人账户余额69120元（不含利息收入）除以139，每月个人账户养老金为497.27元。

合计每月养老金为1777.27元。

通过以上对比计算，按照100%缴费每月养老金为2428.78元，按照60%缴费每月养老金为1777.27元，二者每月养老金相差651.51元，按照60%缴费比按照100%缴费每月的养老金相差比例为27%左右。按照结构来计算，基础养老金部分相差20%，个人账户养老金部分相差40%。

综上所述，按照100%缴费和按照60%缴费，养老保险的缴费基数相差了40%，缴费金额也相差了40%。但退休后的养老金只相差了27%，这是由于使用的养老金计发基数相同而导致的。养老金计发基数的统一，按照指数化缴费工资来计算基础养老金，是全民共享社会发展成果在养老金计算中的具体体现。